La carnitina acetiltransferasa ( CRAT )

Este enzima es codificado por un gen localizado en el cromosoma 9  ( 9q34.1 ), y expresa 3 variantes de mRNA por splicing alternativo, que originan 3 isoformas enzimáticas. La isoforma 1 se encuentra en mitocondria, la isoforma 2 se encuentra en peroxisomas. La variante 3 debe ser mitocondrial según se discute más abajo.

La carnitina acetiltransferasa

Sinónimos : carnitina acetiltransferasa. 

Localización del gen :  cromosoma 9 ( 9q34.1 ).

Secuencia del mRNA :  

                           variante 1  : NM_000755

                           variante 2  : NM_004003

                           variante 3  : NM_144782

Secuencia de la proteína : 

                          variante 1  :  NP_000746.2 carnitina palmitoiltransferase 1B isoforma 1

                           variante 2  :  NP_003994.2 carnitina palmitoiltransferase 1B isoforma 2

                           variante 3  :  NP_659006.1 carnitina palmitoiltransferase 1B isoforma 3

Número de EC : 2.3.1.7

Información OMIM : 600184

Información sobre variantes o isoformas :  Si comparamos las estructuras primarias de las tres isoformas proteicas podemos ver que las variantes 1 y 3 tienen el péptido lider mitocondrial ( mlafaartvv kplgflkpfs ) en su extremo N-terminal. La variante peroxisomal  ( variante 2 ) carece de este péptido lider.

Las diferencias entre las variantes 1 y 3 residen en un fragmento interno ( siftvclda tmprvsedvy  rshvagqmlh gggsrlnsgn rwfdktlqfi vaedgscglv yehaaaegpp ivtlldyvie ytk ) de la variante 1 que no está presente en la variante 3, pero que sin embargo está presente en la variante 2.

Estructura primaria de la VARIANTE 1

1 mlafaartvv kplgflkpfs lmkassrfka hqdalprlpv pplqqsldhy lkalqpivse 61 eewahtkqlv defqasggvg erlqkglerr arktenwlse wwlktaylqy rqpvviyssp 121 gvmlpkqdfv dlqgqlrfaa kliegvldfk vmidnetlpv eylggkplcm nqyyqilssc 181 rvpgpkqdtv snfsktkkpp thitvvhnyq ffeldvyhsd gtpltadqif vqlekiwnss 241 lqtnkepvgi ltsnhrnswa kayntlikdk vnrdsvrsiq ksiftvclda tmprvsedvy 301 rshvagqmlh gggsrlnsgn rwfdktlqfi vaedgscglv yehaaaegpp ivtlldyvie 361 ytkkpelvrs pmvplpmpkk lrfnitpeik sdiekakqnl simiqdldit vmvfhhfgkd 421 fpkseklspd afiqmalqla yyriygqaca tyesaslrmf hlgrtdtirs asmdsltfvk 481 amddssvteh qkvellrkav qahrgytdra irgeafdrhl lglklqaied lvsmpdifmd 541 tsyaiamhfh lstsqvpakt dcvmffgpvv pdgygvcynp meahinfsls aynscaetna 601 arlahyleka lldmrallqs hprakl

Estructura primaria de la VARIANTE 2

1 mkassrfkah qdalprlpvp plqqsldhyl kalqpivsee ewahtkqlvd efqasggvge 61 rlqkglerra rktenwlsew wlktaylqyr qpvviysspg vmlpkqdfvd lqgqlrfaak 121 liegvldfkv midnetlpve ylggkplcmn qyyqilsscr vpgpkqdtvs nfsktkkppt 181 hitvvhnyqf feldvyhsdg tpltadqifv qlekiwnssl qtnkepvgil tsnhrnswak 241 ayntlikdkv nrdsvrsiqk siftvcldat mprvsedvyr shvagqmlhg ggsrlnsgnr 301 wfdktlqfiv aedgscglvy ehaaaegppi vtlldyviey tkkpelvrsp mvplpmpkkl 361 rfnitpeiks diekakqnls imiqdlditv mvfhhfgkdf pkseklspda fiqmalqlay 421 yriygqacat yesaslrmfh lgrtdtirsa smdsltfvka mddssvtehq kvellrkavq 481 ahrgytdrai rgeafdrhll glklqaiedl vsmpdifmdt syaiamhfhl stsqvpaktd 541 cvmffgpvvp dgygvcynpm eahinfslsa ynscaetnaa rlahylekal ldmrallqsh 601 prakl

Estructura primaria de la VARIANTE 3

1 mlafaartvv kplgflkpfs lmkassrfka hqdalprlpv pplqqsldhy lkalqpivse 61 eewahtkqlv defqasggvg erlqkglerr arktenwlse wwlktaylqy rqpvviyssp 121 gvmlpkqdfv dlqgqlrfaa kliegvldfk vmidnetlpv eylggkplcm nqyyqilssc 181 rvpgpkqdtv snfsktkkpp thitvvhnyq ffeldvyhsd gtpltadqif vqlekiwnss 241 lqtnkepvgi ltsnhrnswa kayntlikdk vnrdsvrsiq k kpelvrspm vplpmpkklr 301 fnitpeiksd iekakqnlsi miqdlditvm vfhhfgkdfp kseklspdaf iqmalqlayy 361 riygqacaty esaslrmfhl grtdtirsas mdsltfvkam ddssvtehqk vellrkavqa 421 hrgytdrair geafdrhllg lklqaiedlv smpdifmdts yaiamhfhls tsqvpaktdc 481 vmffgpvvpd gygvcynpme ahinfslsay nscaetnaar lahylekall dmrallqshp 541 rakl