OligoCalculator

Calculador de Tm para Oligonucleotidos

OligoCalculator was written by eugen buehler and modified by lab314.com

La inclusión de OligoCalculator en este sitio web ha sido autorizada expresamente por su autor

Introducir la secuencia del Oligo en el cuadro inferior

                                             

Longitud del oligo

 

nucleotidos

Temperatura de Fusión del oligo

Melting Temperature (Tm) 

°C

 Contenido en GC

%

Peso Molecular

daltons (g/M)

Concentración / Unidad de Absorbancia 

OD 1 es igual a nanoMolar

A Useful Hint From Bharat Patel's Laboratory

The OligoCalculator calculates Tm based on 0.195M monovalent cation (salt) concentration equal to 1x SSC. For calculating Tm values of oligonucleotides (10 to 50) at different monovalent cation concentrations, the formula given below is used. Using the Oligocalculator and the formula, you can calculate the Tm of your favourite oligonucleotide amplification primers eg in the Promega PCR buffer (which contains 0.05M monovalent cations) or the Tm of your DIG-labelled oligonucleotide probes which are usually used with 0.975M monovalent cations (5x SSC).

Required Tm= Known Tm + 16.6log (required salt concentration / 0.195M), where the Known Tm is calculated from 0.195M using the OligoCalculator.

 

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