Gen de la subunidad proteica mitocondrial MTND1 y RNA 13

 

 

La proteína MTND1 es la proteína 1 de las codificadas por el genoma mitocondrial humano, también llamada subunidad 1 del COMPLEJO I de la cadena transportadora de electrones, subunidad 1 de la NADH Deshidrogenasa y subunidad 1 de la NADH CoQ Reductasa.

protein_id = AAB58943.1

Estructura primaria de 318 aminoácidos :

 

MPMANLLLLIVPILIAMAFLMLTERKILGYMQLRKGPNVVGPYGLLQPFADAMKLFTKEPLKPATSTI

TLYITAPTLALTIALLLWTPLPMPNPLVNLNLGLLFILATSSLAVYSILWSGWASNSNYALIGALRAV

AQTISYEVTLAIILLSTLLMSGSFNLSTLITTQEHLWLLLPSWPLAMMWFISTLAETNRTPFDLAEGE

SELVSGFNIEYAAGPFALFFMAEYTNIIMMNTLTTTIFLGTTYDALSPELYTTYFVTKTLLLTSLFLW

IRTAYPRFRYDQLMHLLWKNFLPLTLALLMWYVSMPITISSIPPQT 

 

RNA 13 : Este mRNA está poliadenilado. Se encuentra entre las posiciones 3305 y 4262 del DNA mitocondrial, estando a continuación la cola polyA ( en negrita ). 

Longitud del RNA 13 : 956 nucleotidos + cola polyA

La ORF de 957 nucleotidos está comprendida entre las posiciones del genoma 3307 y 4262 + la primera A de la cola polyA que forma parte del codon STOP UAA ( en la secuencia Fasta format TAA). Iniciandose con AUA (ATA).

Su secuencia Fasta format es:

 

.... ....ACAtac ccatggccaa cctcctactc ctcattgtac ccattctaat cgcaatggca

3361 ttcctaatgc ttaccgaacg aaaaattcta ggctatatac aactacgcaa aggccccaac

3421 gttgtaggcc cctacgggct actacaaccc ttcgctgacg ccataaaact cttcaccaaa

3481 gagcccctaa aacccgccac atctaccatc accctctaca tcaccgcccc gaccttagct

3541 ctcaccatcg ctcttctact atgaaccccc ctccccatac ccaaccccct ggtcaacctc

3601 aacctaggcc tcctatttat tctagccacc tctagcctag ccgtttactc aatcctctga

3661 tcagggtgag catcaaactc aaactacgcc ctgatcggcg cactgcgagc agtagcccaa

3721 acaatctcat atgaagtcac cctagccatc attctactat caacattact aataagtggc

3781 tcctttaacc tctccaccct tatcacaaca caagaacacc tctgattact cctgccatca

3841 tgacccttgg ccataatatg atttatctcc acactagcag agaccaaccg aacccccttc

3901 gaccttgccg aaggggagtc cgaactagtc tcaggcttca acatcgaata cgccgcaggc

3961 cccttcgccc tattcttcat agccgaatac acaaacatta ttataataaa caccctcacc

4021 actacaatct tcctaggaac aacatatgac gcactctccc ctgaactcta cacaacatat

4081 tttgtcacca agaccctact tctaacctcc ctgttcttat gaattcgaac agcatacccc

4141 cgattccgct acgaccaact catacacctc ctatgaaaaa acttcctacc actcacccta

4201 gcattactta tatgatatgt ctccataccc attacaatct ccagcattcc ccctcaaacc

4261 taaaaaaaaaaaaaaaaaaa .......... .......... .......... ..........

 

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