Gen de la subunidad proteica mitocondrial CO1, RNA 6 y RNA 9
La proteína CO1 del genoma mitocondrial humano, también es llamada subunidad 1 del COMPLEJO IV de la cadena transportadora de electrones, y subunidad 1 de la Citocromo oxidasa.
protein_id = AAB58945.1
Estructura primaria de 513 aminoácidos :
MFADRWLFSTNHKDIGTLYLLFGAWAGVLGTALSLLIRAELGQPGNLLGNDHIYNVIVTAHAFVMIFFMV
MPIMIGGFGNWLVPLMIGAPDMAFPRMNNMSFWLLPPSLLLLLASAMVEAGAGTGWTVYPPLAGNYSHPG
ASVDLTIFSLHLAGVSSILGAINFITTIINMKPPAMTQYQTPLFVWSVLITAVLLLLSLPVLAAGITMLL
TDRNLNTTFFDPAGGGDPILYQHLFWFFGHPEVYILILPGFGMISHIVTYYSGKKEPFGYMGMVWAMMSI
GFLGFIVWAHHMFTVGMDVDTRAYFTSATMIIAIPTGVKVFSWLATLHGSNMKWSAAVLWALGFIFLFTV
GGLTGIVLANSSLDIVLHDTYYVVAHFHYVLSMGAVFAIMGGFIHWFPLFSGYTLDQTYAKIHFTIMFIG
VNLTFFPQHFLGLSGMPRRYSDYPDAYTTWNILSSVGSFISLTAVMLMIFMIWEAFASKRKVLMVEEPSM
NLEWLYGCPPPYHTFEEPVYMKS
RNA 9 : Este mRNA está poliadenilado. Se encuentra entre las posiciones 5901 y 7517 del DNA mitocondrial, estando a continuación la cola polyA ( en negrita ).
RNA 6 : Es un RNA poliadenilado precursor del RNA 9.
Longitud del RNA 9 : 1617 nucleotidos + cola polyA
La ORF de 1542 nucleotidos está comprendida entre las posiciones del genoma 5904 y 7445. Iniciandose con AUG (ATG) y terminando con AGA (STOP codon AGA).
Su secuencia Fasta format es:
5881 .......... .......... ctgatgttcg ccgaccgttg actattctct acaaaccaca
5941 aagacattgg aacactatac ctattattcg gcgcatgagc tggagtccta ggcacagctc
6001 taagcctcct tattcgagcc gagctgggcc agccaggcaa ccttctaggt aacgaccaca
6061 tctacaacgt tatcgtcaca gcccatgcat ttgtaataat cttcttcata gtaataccca
6121 tcataatcgg aggctttggc aactgactag ttcccctaat aatcggtgcc cccgatatgg
6181 cgtttccccg cataaacaac ataagcttct gactcttacc tccctctctc ctactcctgc
6241 tcgcatctgc tatagtggag gccggagcag gaacaggttg aacagtctac cctcccttag
6301 cagggaacta ctcccaccct ggagcctccg tagacctaac catcttctcc ttacacctag
6361 caggtgtctc ctctatctta ggggccatca atttcatcac aacaattatc aatataaaac
6421 cccctgccat aacccaatac caaacgcccc tcttcgtctg atccgtccta atcacagcag
6481 tcctacttct cctatctctc ccagtcctag ctgctggcat cactatacta ctaacagacc
6541 gcaacctcaa caccaccttc ttcgaccccg ccggaggagg agaccccatt ctataccaac
6601 acctattctg atttttcggt caccctgaag tttatattct tatcctacca ggcttcggaa
6661 taatctccca tattgtaact tactactccg gaaaaaaaga accatttgga tacataggta
6721 tggtctgagc tatgatatca attggcttcc tagggtttat cgtgtgagca caccatatat
6781 ttacagtagg aatagacgta gacacacgag catatttcac ctccgctacc ataatcatcg
6841 ctatccccac cggcgtcaaa gtatttagct gactcgccac actccacgga agcaatatga
6901 aatgatctgc tgcagtgctc tgagccctag gattcatctt tcttttcacc gtaggtggcc
6961 tgactggcat tgtattagca aactcatcac tagacatcgt actacacgac acgtactacg
7021 ttgtagccca cttccactat gtcctatcaa taggagctgt atttgccatc ataggaggct
7081 tcattcactg atttccccta ttctcaggct acaccctaga ccaaacctac gccaaaatcc
7141 atttcactat catattcatc ggcgtaaatc taactttctt cccacaacac tttctcggcc
7201 tatccggaat gccccgacgt tactcggact accccgatgc atacaccaca tgaaacatcc
7261 tatcatctgt aggctcattc atttctctaa cagcagtaat attaataatt ttcatgattt
7321 gagaagcctt cgcttcgaag cgaaaagtcc taatagtaga agaaccctcc ataaacctgg
7381 agtgactata tggatgcccc ccaccctacc acacattcga agaacccgta tacataaaat
7441 ctagacaaaa aaggaaggaa tcgaaccccc caaagctggt ttcaagccaa ccccatggcc
7501 tccatgactt tttcaaaAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAA....... ..........