Gen de la proteína mitocondrial Cytb y RNA 11

 

La proteína Cytb del genoma mitocondrial humano, es la proteína del citocromo b de la cadena transportadora de electrones.

protein_id = AAB58955.1

Estructura primaria de 378 aminoácidos :

 

MTPMRKINPLMKLINHSFIDLPTPSNISAWWNFGSLLGACLILQITTGLFLAMHYSPDASTAFSSIAHIT

RDVNYGWIIRYLHANGASMFFICLFLHIGRGLYYGSFLYSETWNIGIILLLATMATAFMGYVLPWGQMSF

WGATVITNLLSAIPYIGTDLVQWIWGGYSVDSPTLTRFFTFHFILPFIIAALATLHLLFLHETGSNNPLG

ITSHSDKITFHPYYTIKDALGLLLFLLSLMTLTLFSPDLLGDPDNYTLANPLNTPPHIKPEWYFLFAYTI

LRSVPNKLGGVLALLLSILILAMIPILHMSKQQSMMFRPLSQSLYWLLAADLLILTWIGGQPVSYPFTII

GQVASVLYFTTILILMPTISLIENKMLK                                          

 

RNA 11 : Este mRNA está poliadenilado. Se encuentra entre las posiciones 14747 y 15881 del DNA mitocondrial, estando a continuación la cola polyA ( en negrita ). 

En la base de datos del Genbank tiene un error al señalarlo desde 14747 a 15887, lo que originaría en la ORF dos aminoácidos adicionales ( Triptófano y Alanina ) en el extremo C-terminal que no existen en la proteína.

Longitud del RNA 11 : 1135 nucleotidos + cola polyA

La ORF de 1137 nucleotidos está comprendida entre las posiciones del genoma 14747 y 15881 + las dos primeras As de la cola polyA que forman parte del codon STOP UAA ( en la secuencia Fasta format TAA). Iniciandose con AUG (ATG). 

Su secuencia Fasta format es:

 

 ..... .......... .......... .......... .......... ......atga ccccaatacg

 14761 caaaattaac cccctaataa aattaattaa ccactcattc atcgacctcc ccaccccatc

 14821 caacatctcc gcatgatgaa acttcggctc actccttggc gcctgcctga tcctccaaat

 14881 caccacagga ctattcctag ccatgcacta ctcaccagac gcctcaaccg ccttttcatc

 14941 aatcgcccac atcactcgag acgtaaatta tggctgaatc atccgctacc ttcacgccaa

 15001 tggcgcctca atattcttta tctgcctctt cctacacatc gggcgaggcc tatattacgg

 15061 atcatttctc tactcagaaa cctgaaacat cggcattatc ctcctgcttg caactatagc

 15121 aacagccttc ataggctatg tcctcccgtg aggccaaata tcattctgag gggccacagt

 15181 aattacaaac ttactatccg ccatcccata cattgggaca gacctagttc aatgaatctg

 15241 aggaggctac tcagtagaca gtcccaccct cacacgattc tttacctttc acttcatctt

 15301 gcccttcatt attgcagccc tagcaacact ccacctccta ttcttgcacg aaacgggatc

 15361 aaacaacccc ctaggaatca cctcccattc cgataaaatc accttccacc cttactacac

 15421 aatcaaagac gccctcggct tacttctctt ccttctctcc ttaatgacat taacactatt

 15481 ctcaccagac ctcctaggcg acccagacaa ttatacccta gccaacccct taaacacccc

 15541 tccccacatc aagcccgaat gatatttcct attcgcctac acaattctcc gatccgtccc

 15601 taacaaacta ggaggcgtcc ttgccctatt actatccatc ctcatcctag caataatccc

 15661 catcctccat atatccaaac aacaaagcat aatatttcgc ccactaagcc aatcacttta

 15721 ttgactccta gccgcagacc tcctcattct aacctgaatc ggaggacaac cagtaagcta

 15781 cccttttacc atcattggac aagtagcatc cgtactatac ttcacaacaa tcctaatcct

 15841 aataccaact atctccctaa ttgaaaacaa aatactcaaa tAAAAAAAAA AAAAAAAAAA

 

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