Gen de la subunidad proteica mitocondrial MTND5, RNA 4 y RNA5 

 

La proteína MTND5 es la proteína 5 de las codificadas por el genoma mitocondrial humano, también llamada subunidad 5 del COMPLEJO I de la cadena transportadora de electrones, subunidad 5 de la NADH Deshidrogenasa y subunidad 5 de la NADH CoQ Reductasa.

protein_id = AAB58953.1

Estructura primaria de 603 aminoácidos :

MTMHTTMTTLTLTSLIPPILTTLVNPNKKNSYPHYVKSIVASTFIISLFPTTMFMCLDQEVIISNWHWAT

TQTTQLSLSFKLDYFSMMFIPVALFVTWSIMEFSLWYMNSDPNINQFFKYLLIFLITMLILVTANNLFQL

FIGWEGVGIMSFLLISWWYARADANTAAIQAILYNRIGDIGFILALAWFILHSNSWDPQQMALLNANPSL

TPLLGLLLAAAGKSAQLGLHPWLPSAMEGPTPVSALLHSSTMVVAGIFLLIRFHPLAENSPLIQTLTLCL

GAITTLFAAVCALTQNDIKKIVAFSTSSQLGLMMVTIGINQPHLAFLHICTHAFFKAMLFMCSGSIIHNL

NNEQDIRKMGGLLKTMPLTSTSLTIGSLALAGMPFLTGFYSKDHIIETANMSYTNAWALSITLIATSLTS

AYSTRMILLTLTGQPRFPTLTNINENNPTLLNPIKRLAAGSLFAGFLITNNISPASPFQTTIPLYLKLTA

LAVTFLGLLTALDLNYLTNKLKMKSPLCTFYFSNMLGFYPSITHRTIPYLGLLTSQNLPLLLLDLTWLEK

LLPKTISQHQISTSIITSTQKGMIKLYFLSFFFPLILTLLLIT                                      

 

RNA 5 : Este mRNA está poliadenilado. Su estructura comienza en la posición 12337 del DNA mitocondrial, pero se desconoce el extremo 3'.

Longitud del RNA 5 :  se desconoce

La ORF está comprendida entre las posiciones  12337 y 14148. Iniciandose con AUA (ATA) y terminando con UAA (STOP codon TAA).

Su secuencia Fasta format es:

 

 ..... .......... .......... .......... ......ataa ccatgcacac tactataacc

 12361 accctaaccc tgacttccct aattcccccc atccttacca ccctcgttaa ccctaacaaa

 12421 aaaaactcat acccccatta tgtaaaatcc attgtcgcat ccacctttat tatcagtctc

 12481 ttccccacaa caatattcat gtgcctagac caagaagtta ttatctcgaa ctgacactga

 12541 gccacaaccc aaacaaccca gctctcccta agcttcaaac tagactactt ctccataata

 12601 ttcatccctg tagcattgtt cgttacatgg tccatcatag aattctcact gtgatatata

 12661 aactcagacc caaacattaa tcagttcttc aaatatctac tcatcttcct aattaccata

 12721 ctaatcttag ttaccgctaa caacctattc caactgttca tcggctgaga gggcgtagga

 12781 attatatcct tcttgctcat cagttgatga tacgcccgag cagatgccaa cacagcagcc

 12841 attcaagcaa tcctatacaa ccgtatcggc gatatcggtt tcatcctcgc cttagcatga

 12901 tttatcctac actccaactc atgagaccca caacaaatag cccttctaaa cgctaatcca

 12961 agcctcaccc cactactagg cctcctccta gcagcagcag gcaaatcagc ccaattaggt

 13021 ctccacccct gactcccctc agccatagaa ggccccaccc cagtctcagc cctactccac

 13081 tcaagcacta tagttgtagc aggaatcttc ttactcatcc gcttccaccc cctagcagaa

 13141 aatagcccac taatccaaac tctaacacta tgcttaggcg ctatcaccac tctgttcgca

 13201 gcagtctgcg cccttacaca aaatgacatc aaaaaaatcg tagccttctc cacttcaagt

 13261 caactaggac tcataatagt tacaatcggc atcaaccaac cacacctagc attcctgcac

 13321 atctgtaccc acgccttctt caaagccata ctatttatgt gctccgggtc catcatccac

 13381 aaccttaaca atgaacaaga tattcgaaaa ataggaggac tactcaaaac catacctctc

 13441 acttcaacct ccctcaccat tggcagccta gcattagcag gaataccttt cctcacaggt

 13501 ttctactcca aagaccacat catcgaaacc gcaaacatat catacacaaa cgcctgagcc

 13561 ctatctatta ctctcatcgc tacctccctg acaagcgcct atagcactcg aataattctt

 13621 ctcaccctaa caggtcaacc tcgcttcccc acccttacta acattaacga aaataacccc

 13681 accctactaa accccattaa acgcctggca gccggaagcc tattcgcagg atttctcatt

 13741 actaacaaca tttcccccgc atcccccttc caaacaacaa tccccctcta cctaaaactc

 13801 acagccctcg ctgtcacttt cctaggactt ctaacagccc tagacctcaa ctacctaacc

 13861 aacaaactta aaataaaatc cccactatgc acattttatt tctccaacat actcggattc

 13921 taccctagca tcacacaccg cacaatcccc tatctaggcc ttcttacgag ccaaaacctg

 13981 cccctactcc tcctagacct aacctgacta gaaaagctat tacctaaaac aatttcacag

 14041 caccaaatct ccacctccat catcacctca acccaaaaag gcataattaa actttacttc

 14101 ctctctttct tcttcccact catcctaacc ctactcctaa tcacataa.. ..........

 

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