Gen de la subunidad proteica mitocondrial MTND6 y su RNA no descrito

 

 

La proteína MTND6 es la proteína 6 de las codificadas por el genoma mitocondrial humano, también llamada subunidad 6 del COMPLEJO I de la cadena transportadora de electrones, subunidad 6 de la NADH Deshidrogenasa y subunidad 6 de la NADH CoQ Reductasa.

protein_id = AAB58954.1

Estructura primaria de  174 aminoácidos :

MMYALFLLSVGLVMGFVGFSSKPSPIYGGLVLIVSGVVGCVIILNFGGGYMGLMVFLIYLGGMMVVFGYT

TAMAIEEYPEAWGSGVEVLVSVLVGLAMEVGLVLWVKEYDGVVVVVNFNSVGSWMIYEGEGSGLIREDPI

GAGALYDYGRWLVVVTGWTLFVGVYIVIEIARGN                                     

 

RNA  : Este mRNA no se ha descrito, siendo el único RNA mitocondrial que carece de nombre, y del que se desconoce incluso si está poliadenilado.

La ORF se encuentra entre las posiciones 14149 y 14673 del DNA mitocondrial ( complementario, y por lo tanto con dirección de lectura de 14673 a 14149 ). El triplete de las posiciones 14147-14148-14149 es el STOP codon AGG ( en la cadena complementaria H que usamos de referencia en el genoma es CCT ). Iniciandose con AUG (ATG) que en la cadena complementaria H que usamos de referencia en el genoma es CAT.

Longitud del RNA :  desconocida

La secuencia de la ORF Fasta format es ( para la cadena complementaria ) :

 

 ..... .......... .......... .......... .......... ........cc tattcccccg

 14161 agcaatctca attacaatat atacaccaac aaacaatgtt caaccagtaa ctactactaa

 14221 tcaacgccca taatcataca aagcccccgc accaatagga tcctcccgaa tcaaccctga

 14281 cccctctcct tcataaatta ttcagcttcc tacactatta aagtttacca caaccaccac

 14341 cccatcatac tctttcaccc acagcaccaa tcctacctcc atcgctaacc ccactaaaac

 14401 actcaccaag acctcaaccc ctgaccccca tgcctcagga tactcctcaa tagccatcgc

 14461 tgtagtatat ccaaagacaa ccatcattcc ccctaaataa attaaaaaaa ctattaaacc

 14521 catataacct cccccaaaat tcagaataat aacacacccg accacaccgc taacaatcaa

 14581 tactaaaccc ccataaatag gagaaggctt agaagaaaac cccacaaacc ccattactaa

 14641 acccacactc aacagaaaca aagcatacat cat....... .......... ..........

 

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